ساهم بيت الزكاة الكويتي في دعم للاجئين الروهينجا المتواجدين في بنغلاديش إلى مشاريع التعليم والإغاثة والصحة (كوفيد -19) وفي موريتانيا لحماية اللاجئين الماليين ، وقعت المفوضية في الكويت مذكرة تفاهم مع بيت الزكاة الكويتي في مايو عام 2000.